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因为物种自由交配意味着每一代都有尽可能多的基因流动，这会导致后代的基因频率与亲代接近。即使存在其他影响因素，只要没有显著干扰物种自然交配过程，其后代的基因频率基本保持不变。这是基于自然选择和遗传漂变等过程的假设下得出的结论。
然而，在实际情况中，存在一些限制和干扰因素。例如，地理隔离、生态位重叠、基因突变以及外部环境条件等因素可能会对物种自由交配产生负面影响，并导致基因频率发生变化。
此外，在人工选择和特定环境条件下，物种自由交配也可能产生不同的结果。例如，在繁殖季节受限或其他限制条件下，交配行为可能会出现异常，并且由此产生的后代基因频率与亲代存在明显差异。
因此，在考虑物种自由交配是否会导致后代基因频率改变时，我们需要综合考虑多种因素，并根据具体情况进行判断。

不是
因为即使能产生后代，后代也是不育的，也就是说不能将上一代这两个物种的基因遗传下去。

导致种群基因频率改变的因素有:基因突变、基因重组(叉互换导致的)，迁入和迁出，遗传漂变等。说物种自由交配时没有上述因素介入，故而。

答案C
AA占16%、Aa占48%、aa占36%。（1）随机交配情况：产生的雌雄配子均是A（40%）、a（60%），雌雄配子随机交配，后代AA占16%、Aa（48%）、aa（36%），A基因频率为40%。（2）自交情况：自交后代AA占16%+12%＝28%、Aa占24%、aa占48%，A基因频率为40%。

【1】影响基因频率的因素从专业的角度说，只有四种：突变、自然选择、迁移、和遗传漂变。重组本身自己是不会改变基因频率，只有与以上四种因素结合，才会对基因频率表现出影响。当在一个小的有限群体中，基因重组不完全，从而使后代基因和基因型频率发生变化，这属于遗传漂变的一种。 【2】自由交配必然发生在孟德尔群体中，理论上说无限大，能够进行完全的重组，所以基因频率是不发生变化的。比如说：A（p）：a（q）大群体，能够自由交配，后代群体足够大，则基因频率不变化。但如果A（p）：a（q）小群体，比如说只有三个个体，分别是AA，Aa，aa，产生的后代群体也有三个个体，则后代的基因频率保持原有基因频率的概率就比较小。

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